所謂石墨消解就是將加熱樣品放在石墨孔中間，利用石墨的耐高溫性能作為加熱介質進行消解的一種辦法。石墨消解一次可以消解30幾個樣品，甚至可以達到50多個樣品，微波消解儀一次消解數在6至12左右。單從消解時間來看，微波的消解時間要短，但是計算上消解后的降溫、趕酸，以及多個樣品總共的消解時間，兩者各有所長。石墨消解儀是在常溫常壓中消解，樣品冷卻時間比微波消解儀快很多。微波由于可在高壓下消解，所以有些樣品能夠用微波消解，而很難用石墨消解。比如，塑料等樣品。石墨消解在常壓下進行，加熱均勻，不會暴沸和爆罐，沒有安全隱患;而微波消解在高壓下進行，瞬間升壓會使消解罐內壓力陡增，有可能發生爆罐，如果人在旁邊會很危險，并且微波消解加熱不很均勻，只有其中的一個會全消解，其他幾個可能消解不全。微波消解后，還需另外通過電熱板消解進行趕酸，相對比較麻煩，但石墨消解可在消解的同時進行趕酸，所以有微波消解儀的客戶也可另配一石墨消解用于趕酸，安全方便。